2015年1月15日 星期四

STRING ( predict protein protein interaction )


  1. 進入首頁輸入蛋白質名稱或是序列,organism 的地方輸入目標物種。這裡以E. coli的Leucine-responsive Regulatory Protein 為例。

  2. 出現 target protein和其他有相關的protein,點選後可查看這些蛋白的詳細資料。
  3. 圖的下方有一排功能可使用,例如:按"more"可顯示更多關聯性蛋白。

  4. Views的地方可以查看各項詳細資料。

  5. 按下"Summary Network"圖片上方會出現一列功能表。

  6. Enrichment > GO Biological Processes、GO Molecular Functions、GO Cellular Components,可分別去看不同性質的GO關係圖形。
    例如:GO Molecular Functions > DNA binding > 紅色球所顯示。






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