Phylogenetic Tree 繪製物種親緣關係樹 (建立關係樹)

延續之前載下的7個胺基酸序列(有相似的CsrA序列的菌株)建立親緣關係樹。流程圖如下：

1. 打開 phylip-3.69中的 exe資料夾，將之前的 infile.phy的副檔名刪除。
   
   
2. 開啟 seqboot.exe，會出現以下畫面，再依序輸入指令: R > Enter > Numbers of replicates > 200 > Y > Enter > Random number seed > 1
   
   接著會得到一個outfile檔案，將原本infile檔名改成其他名稱(例：CsrA-01)，再將outfile改成infile檔名，方便下個程式開啟。
   
   
3. 打開 protdist.exe程式，如下圖所示，輸入指令: M > multiple data sets (type D) > How many data sets > 200 > Y
   等待系統作業，之後會得到另一個outfile，將上個infile檔名改成其他名稱(CsrA-02)，再將outfile改成infile檔名，方便下個程式開啟。
   
   
4. 打開 neighbor.exe程式，輸入指令: M > How many data sets > 200 > Random number seed > 1 > Y，之後會得到outfile及outtree兩個檔案。
   
   
5. 把之前infile及outfile檔名都改掉，並將 outtree檔名改成 intree，方便下個程式開啟。
   開啟consense.exe程式，輸入指令"Y"後程式會產生 "outfile" 及 "outtree" 兩個檔案。
   
   
   
6. 可用兩種程式開啟outtree，"TreeViewX"和"hypertree-1.2.2"。